O curso de Farmácia da FABA prepara os alunos para atuar em diversas áreas do campo farmacêutico, incluindo fármacos e medicamentos, análises clínicas e toxicológicas, e produção, controle e análise de alimentos. Durante o curso, os estudantes desenvolvem habilidades para realizar pesquisas e preparo de medicamentos, dermocosméticos e produtos de higiene pessoal.
As disciplinas oferecidas capacitam os graduados a examinar e testar substâncias e princípios ativos, observando as reações no organismo, realizar análises clínicas e toxicológicas, dar orientação farmacológica e fazer fármaco-vigilância. Além disso, a FABA se destaca por garantir 100% dos estágios para seus alunos.